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shell脚本小知识一

需求:从第m行到第n行修改文章的内容

例子:小分子的内容

1a30_ligand  Created by X-TOOL on Fri Sep 26 17:34:14 2014  49 48  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000     4.8410   27.5760    5.3100  N 0  3  0  4  0  4     5.7330   26.3940    5.1650  C 0  0  0  2  0  4     7.1740   26.7720    5.5040  C 0  0  0  1  0  3     7.6240   27.8870    5.2180  O 0  0  0  1  0  1     5.6380   25.8180    3.7500  C 0  0  0  3  0  4     5.8270   26.8460    2.6520  C 0  0  0  3  0  4     5.6250   26.2750    1.2620  C 0  5  0  1  0  3     4.6630   25.4970    1.0650  O 0  0  0  1  0  1  25 48  1  0  0  2  25 49  1  0  0  2 M  END > <MOLECULAR_FORMULA> C15H23N3O8  > <MOLECULAR_WEIGHT> 373.2  > <NUM_HB_ATOMS> 11  > <NUM_ROTOR> 9  > <XLOGP2> -2.04  $$$$ 

想改变这个sdf分子坐标部分,想把第三列(即z轴)改成0

代码实现部分

本文件的第5行-第12行将被更改,第三列将被更改为0.0000’

awk 'NR==5,NR==12 {$3="0.0000"}{print}' 1a30_ligand.sdf  >  test.sdf 

结果展示

1a30_ligand  Created by X-TOOL on Fri Sep 26 17:34:14 2014  49 48  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000 4.8410 27.5760 0.0000 N 0 3 0 4 0 4 5.7330 26.3940 0.0000 C 0 0 0 2 0 4 7.1740 26.7720 0.0000 C 0 0 0 1 0 3 7.6240 27.8870 0.0000 O 0 0 0 1 0 1 5.6380 25.8180 0.0000 C 0 0 0 3 0 4 5.8270 26.8460 0.0000 C 0 0 0 3 0 4 5.6250 26.2750 0.0000 C 0 5 0 1 0 3 4.6630 25.4970 0.0000 O 0 0 0 1 0 1  25 48  1  0  0  2  25 49  1  0  0  2 M  END > <MOLECULAR_FORMULA> C15H23N3O8  > <MOLECULAR_WEIGHT> 373.2  > <NUM_HB_ATOMS> 11   > <NUM_ROTOR> 9    > <XLOGP2> -2.04  $$$$ 

注意

为了避免损坏原始数据,可以创建新文件 写入文件可以提前测试几次 要用>而不是>>

标签: 600v2000uf折机电容

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