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【3月30日直播】新冠病毒全基因组测序——Midnight试剂盒及整体解决方案

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基于全球新冠肺炎疫情球范围内肆虐,Nanopore测序技术和数据分析在全球感染性疾病防控中的优势充分显现出来。该平台运用灵活、操作简单、产量快、分析实时,为公共卫生和疫情防控提供了有力的支持和保障。本专题针对新冠肺炎全基因组测序Midnight详细分析了试剂盒和整体解决方案。同时分享新冠肺炎全基因组测序数据、技术参数和客户体验。

来自3月30日的我们邀请,纳米孔长读长测序技术在全球新冠肺炎疫情中的应用Midnight新冠肺炎全基因组测序工作流程在线研讨会。

?纳米孔测序在全球新冠肺炎疫情中的应用

?Midnight新冠全基因组测序试剂盒的原理、流程和数据性能

?纳米孔新冠全基因组数据分析流程介绍

?新冠肺炎阳性标本病毒变异常规监测

?基于三代测序平台ARTIC叠瓦扩增子建库测序方法

?运用Midnight V德尔塔病毒1200建库方法的测序

258117223@qq.com

湖南省疾病预防控制中心微生物检测科主管技师向星宇主要从事流感、麻疹/风疹等呼吸道病原体的检测、分离和鉴定。承担十三五重大专项子项目,发表多篇中英文论文。湖南省预防医学科学技术奖一等奖(2018年)参与建立发热呼吸道症候群病原体检测平台,发现新病原体。从2020年开始,承担全省新冠肺炎基因组的测序和分析。

为了更好地开展新冠肺炎可追溯性和变异监测等疫情防控工作,为流行病调查和风险评估提供技术支持,湖南省疾病防控中心于2020年采购Nanopore的Gridion三代测序平台。自2021年以来,湖南省疾病预防控制中心利用三代测序平台对输入性病例阳性标本病毒变异进行了常规监测,贝塔、阿尔法、德尔塔、奥密克荣等变异株相继从本省入境航班检测出来,为评估本省输入风险和病毒变异趋势提供了实验室依据。除常规监测外,我们在2021年7月湖南省德尔塔疫情中使用了基于三代测序平台的ARTIC在人员和设备短缺的情况下,采用一套设备完成了全省140多例病例的测序溯源工作。在接下来的10月德尔塔疫情中,我们又应用了midnight V1200进一步缩短了建库时间,提高了操作方便性。第三代测序溯源还用于快速识别某些疫苗污染引起的假阳性事件,使流行病学调查和事件处理更加顺利。随着病毒的不断变化,基于多种病毒PCR叠瓦扩增子建库方法也遇到了挑战。变异位点的不断增加导致库中某些扩增子的敏感性降低或缺失。因此,我们在工作中不断改进、调整和改进,最终取得满意的效果。

牛津纳米孔技术公司 领域应用技术专家

毕业于上海交通大学,获得生物学博士学位

?曾在河北农业大学从事微生物、食品安全教学和华大智能制造高通量测序技术应用;

?长期致力于病原微生物检测和流行病学研究;

?熟悉高通量测序技术。

?曾参加国家863, 973.自然科学基金、国家科技重大专项、科技部专项研究;

?发表SCI、EI、20多篇中文核心期刊论文。

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